Tag Archives: CRISPR

Научни новини: Генетични редакции, ракети и сателити

Post Syndicated from Михаил Ангелов original https://www.toest.bg/nauchni-novini-genetichni-redaktsii-raketi-i-sateliti/

Генетичните редакции скоро ще са в Европа

Научни новини: Генетични редакции, ракети и сателити

Три години след предложението на Европейската комисия да се преразгледа правната рамка, регулираща растенията, които са претърпели генетични редакции, то бе гласувано и прието в Европейския парламент.

Мерките като цяло следват предложението на Комисията и в тях са обособени две категории растения.

Първата обхваща растения, получени с помощта на новите геномни технологии, като CRISPR, в които няма големи намеси, например внасяне на ДНК от други видове или промяна на големи участъци от генома. В текста има няколко специфични ограничения: внасянето на ДНК може да става само когато то е достъпно и при класическа селекция (тоест от видове, които могат да се кръстосат) и промените не могат да са по-големи от 20 нуклеотида. За изтриването на участъци няма ограничение колко дълъг отрязък може да се премахне, но общият брой на всички промени също е ограничен до 20 броя.

Пречките и надеждите пред CRISPR

Като всеки инструмент, CRISPR може да бъде използван и за спорни цели. Но възможностите, които предлага, са много обещаващи. Някоя от модификациите му или нова подобна система ще бъде в основата на…

Тези рамки са обект на дискусия, защото нямат ясно научно обяснение. Според Европейския орган за безопасност на храните това е консервативно ограничение, което цели намаляване на риска от нежелани ефекти, докато според някои критици на решението така се слагат сериозни пречки пред създаването на нови сортове, които да бъдат адаптирани към променящите се климатични условия.

Важно уточнение е, че от тази категория се изключват растения, които са устойчиви на хербициди и неприятели. Към момента устойчивостта и на двете се получава чрез вмъкване на чужда ДНК (обикновено бактериална) в генома на растенията. Например глифозатът – активното вещество в популярния „Раундъп“, нарушава синтеза на някои аминокиселини в растенията, като засяга един от ензимите, отговорни за това. Този ензим не се среща при животните, поради което пръскането не е токсично за тях.

За да станат растенията устойчиви, в тях се вмъква бактериална версия на същия ензим, която не се влияе от глифозата, и така тези растения оцеляват. Сходна е положението и при културите, устойчиви на насекоми – те отделят бактериален токсин, който засяга някои насекоми, хранещи се с тях, а е безвреден за животните. Има обаче възможност за създаване на устойчиви растения и без трансгенеза (вмъкване на чужда ДНК), например чрез свръхекспресия на дадени гени, които ще се окажат блокирани от по-широка употреба.

Научни новини: ГМО и глобално затопляне

Да си поговорим за ГМО и глобално затопляне. В случая ще говори Михаил Ангелов чрез своите научни новини. Този път е подбрал две големи теми – за генетичните манипулации и за затоплянето на планетата.

Като резултат от промените на територията на ЕС ще могат да се отглеждат свободно всички растения от категория 1, които на практика ще бъдат третирани като получените от конвенционална селекция. Новите правила водят и до друга съществена промяна – страните членки ще бъдат силно ограничени във възможността си да налагат местни закони, забраняващи отглеждането на растения от категория 1, каквито имаше в редица европейски държави, включително и в България, въпреки че сортовете бяха одобрени на европейско ниво. Това обаче не означава, че в държавата до момента не е имало ГМО продукти – например вносът на такива фуражи и суровини за хранителната промишленост е напълно легален.

Приемането им като еквивалентни на конвенционалните води и до това, че 

производителите няма да бъдат задължени да отбелязват на етикетите, че растенията и продуктите, в които са вложени, са били редактирани. 

Означение ще има само на посевния материал.

В особена ситуация се оказват фермерите, отглеждащи органични продукти. По регламент те нямат право да отглеждат растения от първата категория, но „случайното или технически неизбежното“ им наличие в посевите и продуктите няма да води до директно отнемане на органичния сертификат. Подобно „замърсяване“ може да стане след опрашване с полен от съседен посев или случайно разпръскване на семена, но поради характера на новите технологии откриването на редактиран сорт може да бъде изключително трудно – ако редакцията е минимална, тя няма да се различава от случайна мутация. 

Чисто решение няма и най-вероятно с времето ще има период на напасване и организиране на мерки за намаляване на риска. Производителите, които все още не го правят, ще трябва да започнат стриктно да пазят документацията за произхода на семената, които са използвали. Пространствената изолация от съседни посеви също може да помогне. Възможно е и създаването на своеобразни „молекулярни отпечатъци“ на новите сортове, които да ги каталогизират, подобно на сегашното спазване на правилата за различимост, хомогенност и стабилност (РХС), прилагани в конвенционалната селекция.

Тоест разговаряме – епизод 7

Как се разказва за наука разбираемо и отговорно? И защо критичното мислене е ключово в епохата на псевдонаучни твърдения и конспиративни интерпретации? Отговори на тези въпроси ни дава биологът и автор на „Научни новини“ Михаил Ангелов в седмия епизод на „Тоест разговаряме“.

В научните среди няма консенсус и дали всъщност новите растения следва да бъдат изключени от органичното земеделие. Консервативните нагласи са, че в него трябва да продължи спазването на по-класически методи за отглеждане, с ограничени третирания и сортове, получени с помощта на старата селекционна школа. От друга страна, натискът на климатичните промени ще затруднява този тип земеделие, а възможността за използване на сортове, съобразени с новите условия, е подходящ начин за облекчаване на работата.

Растенията от категория 2, в които са извършени по-сложни намеси, остават под действащото стриктно законодателство и ще преминават през задължителна оценка на риска, издаване на разрешение на отглеждане, а след това проследяемост и обозначаване на етикетите както на семената, така и на продуктите, получени от такива суровини.

Наред с биологичната безопасност стои въпросът с икономическата.

Към момента в Европа е възможно патентоването на генетично модифицирани растения, стига промените да не са резултат от „естествен биологичен процес“. С оглед на новите правила такъв тип патенти обяснимо създават напрежение, предвид силната концентрация на семепроизводството в няколко световни гиганта – четири фирми (Bayer, Corteva, Syngenta и BASF) контролират над 50% от световния пазар. Това им дава значителна преднина, тъй като те вече имат големи отдели за разработка на сортове с помощта на новите инструменти за селекция. 

В началото на 2024 г. имаше предложение патентите за новите технологии да отпаднат напълно, но през декември 2025 г. то беше отхвърлено. Във вече приетите правила патентите са възможни, но селекционерите ще са длъжни да подават подробна патентна информация в публична база данни. Доброволно ще е съобщаването дали смятат да лицензират въпросната технология и при какви условия. Ще бъде създадена и експертна група, в която ще участват представители на държавите членки, Европейския патентен офис и Службата на Общността за сортовете растения. 

Една година след като правилата влязат в сила, Европейската комисия ще публикува проучване на ефекта от патентите върху иновациите, достъпа на фермерите до семена и конкурентоспособността на селекционерите в Европа, което ще послужи като основа за промяна на регулациите, ако бъдат открити проблеми.

Засега можем само да спекулираме как ще се развият събитията, но възможността за патентоване на технологии и модифицирани сортове повдига известни тревоги. В регламента е записано, че Комисията трябва да насърчава кодекс за поведение, прозрачност и честност в лицензирането, както и уреждане по взаимно съгласие на патентни спорове, особено с малки и средни компании и фермери. На хартия звучи добре, но доказването на случайно замърсяване е трудно, а съдебните процеси, произтичащи от това, са тромави, както е известно от популярното дело „Монсанто“ срещу Шмайзер.

Редактиране на генома с CRISPR

Михаил Ангелов • В последните няколко десетилетия в света на биотехнологиите са направени редица открития. Последният революционен скок в способността ни да променяме света около нас е CRISPR – инструмент, който позволява бързо, достъпно и прецизно редактиране на генома.

По думите на докладчика Джесика Полфьорд 

това е историческа победа за европейските фермери и бъдещето на Европа. 

Според нея с дерегулацията на новите геномни технологии, които са безопасни и научно подкрепени, се подсигурява устойчивото развитие на земеделието в Европа, което дава възможност за създаване на съвременни сортове, по-устойчиви и по-малко зависими от пестициди.

До появата на подобни продукти има още време – предстои официалното приемане на текста от Европейския парламент, след което промените ще бъдат публикувани в Официалния вестник на ЕС и ще влязат в сила 20 дни след това. Пълното прилагане ще започне след 24 месеца, през които ще бъдат изготвени различните правилници, протоколи за наблюдение и други методики. Практически ефектите ще се усетят след средата на 2028 г.

Приземяване на ракети, приземяване на акции

Връщането на ракети беше интересна идея, която SpaceX успя да реализира преди 10 години, намалявайки значително разходите по извеждане на сателити в орбита.

Благодарение на тази иновация компанията се разви значително и стана един от най-важните космически оператори. Компанията на Илон Мъск успя да върне възможността на NASA да изпраща астронавти към Международната космическа станция, за което САЩ разчиташе на Русия и нейните ракети „Съюз“ в продължение на 9 години. В тази връзка, след като САЩ наложи санкции на Русия, директорът на „Роскосмос“ Дмитрий Рогозин коментира, че американците могат да използват трамплин, за да изстрелват астронавтите си. Последва саркастичният отговор на Мъск след първия полет на SpaceX до станцията: „Трамплинът работи.“

Но изглежда, че приземяването на ракетите изведнъж ще се превърне от уникален трик в обикновен ход – в рамките на около половин година към Falcon на SpaceX се присъединиха още няколко.

Миналия ноември ракетата New Glenn на Blue Origin – компанията, финансирана от Джефри Безос, се приземи на баржа, по подобие на подхода на SpaceX, след като успешно изпрати към Марс два апарата за NASA. Това са Blue и Gold в мисията EscaPADE, които ще изучават магнитосферата на планетата и как слънчевият вятър почти изцяло е заличил атмосферата ѝ. 

Към момента компанията планира да използва всяка ракета за поне 25 полета, което значително ще намали тяхната стойност. Впечатление направи и по-големият размер на ракетата, която е с около 10 метра по-висока от тази на SpaceX. В средата на април New Glenn полетя отново, оборудван с нови двигатели. Приземяването му беше успешно, но спътникът, който беше на борда, се оказа в по-ниска от очакваната орбита.

В началото на месеца успешно приземяване, отново на баржа, направи и китайската Long March 10B.

Подходът е малко по-различен – платформата се намира по пътя на ракетата, така че тя трябва да носи по-малко гориво за самото приземяване. Наред с това не е свободно стояща, а се захваща в плетеница от опънати телове, увисвайки в тях. Това помага за увеличаване на товарния ѝ капацитет, тъй като се спестява теглото на краката. 

Този пуск е важен за китайската космическа програма, тъй като е част от по-голямата цел на страната за човешко присъствие в Космоса. Пряк аналог на 10B е 10А, с разликата, че е предвидена да качва не товар, а хора до китайската космическа станция „Тиенгун“. Успешното приземяване значи, че това ще може да става по-често и евтино. Още по-амбициозна е идеята за съединяване на три такива ракети, които могат да изнесат в орбита горна степен, която има възможност да стигне до Луната.

Ще полети ли България в Космоса?

На фона на случващото се в държавата е малко особено да си говорим за Космоса, обаче така като гледаме, само там ще е спасението. Извън шегата и проблемите на злободневието, в този текст Александър Нуцов хвърля поглед към космическата индустрия, която става все по-важна част от бизнеса в целия свят.

Не е изключено от Китай да дойдат още изненади, защото в края на миналата година една частна китайска компания направи неуспешен опит за приземяване, последван от друга разновидност на Long March12A.

Успешни тестове се провеждат и в Япония. Миналата година Honda направи демонстрация на „подскок“ (hop), при който ракетата излита и се изкачва до 300 метра височина, а после се спуска и се приземява. Сходен прототип показа преди броени дни и японската космическа агенция JAXA. Той се изкачи до няколко метра, след което се придвижи хоризонтално и се приземи. Макар и далеч по-малки по размери в сравнение с нормалните ракети носители, тези прототипи показват ясно, че скоро преизползването им ще стане рутинно за повечето космически агенции и компании.

Китайският тест се състоя, когато цената на акциите на SpaceX падна стремглаво след изключително високото им позициониране при появата им на борсата, но най-вероятно между двете събития няма особена връзка.

Според подадените от SpaceX документи преди първоначалното публично предлагане на акциите ѝ само около 7% от стойността на компанията е свързана с космическата ѝ дейност и със сателитния интернет Starlink. От документите става ясно, че SpaceX, изглежда, основно е ИИ компания и високата цена за дял от нея отразява потенциала ѝ да извежда изчислителни центрове в Космоса. Илон Мъск не дава подробности как планира да изпълни тези обещания и да реши важните технически проблеми, които стоят пред реализирането на подобни изчислителни центрове. 

Може би най-голямото инженерно предизвикателство е отвеждането на отделената топлина. Макар Космосът често да се описва като студен, вакуумът е отличен изолатор. Затова единственият начин космическият апарат да се охлажда е чрез излъчване на топлина в инфрачервения спектър посредством специални радиатори. Колкото по-голяма е изчислителната мощност на сателита, толкова повече отпадна топлина генерира той и толкова по-големи или по-ефективни радиатори са необходими.

Допълнително усложнение е слънчевото нагряване. Повечето части на апарата се покриват със специални отразяващи многослойни материали, но радиаторите не могат да бъдат изолирани по този начин, тъй като това би възпрепятствало работата им. Затова те обикновено се разполагат така, че да получават възможно най-малко пряка слънчева светлина.

Близнаците от NASA и ключът към живота ни в Космоса

NASA събира десет изследователски екипа, които проучват промените в човешкото тяло след продължителен престой в Космоса. В изследването участват и еднояйчните близнаци Кели. Скот престоява в Космоса една година, а брат му Марк остава на Земята. Анастасия Орманджиева разказва повече.

От инженерна точка с много големи радиатори и подходяща конструкция на сателитите не е невъзможно идеята да се осъществи, но с наличните в момента технологии (включително микрочипове), изпълнението ще е много скъпо и ще изисква сглобяване на центровете в Космоса, подобно на Международната космическа станция. Алтернатива е изстрелването на повече по-малки изчислителни центрове, но това пък ще вдигне цената поради нуждата от повече ракети и повече шасита, а също така ще увеличи броя сателити в орбита. Последното не е за пренебрегване, защото астрономите вече се оплакват от голямата флотилия спътници, обслужващи Starlink.

Междувременно SpaceX направи поредно тестово изстрелване на StarshipFlight 13. Този път на борда като тестови товар имаше няколко нови сателита Starlink V3, които се отделиха успешно от ракетата, но на суборбитална траектория, като след това се очакваше да изгорят в атмосферата. Самият Starship се представи добре, като най-впечатляващи бяха обръщането му в атмосферата – своеобразна проверка как се държат топлинните му щитове, и последващото меко кацане в океана. В бъдеще тези кацания ще бъдат на ракетни площадки, така че ракетата да може да се преизползва. Носителят Super Heavy се справи с изнасянето на Starship към Космоса, но при кацането се задействаха само част от двигателите му и той направи „твърдо приземяване“ в океана. Този тест беше важен за компанията и за NASA, защото е част от програмата Artemis за изпращане на астронавти на Луната.


Веднъж месечно Михаил Ангелов – биолог, агроном и любим нърд от нашия екип, ни представя най-интересните скорошни новини от различни сфери на науката и обяснява защо тези постижения са толкова значими за света и човечеството. Или най-малкото – любопитни и забавни.

Тоест разговаряме – епизод 7

Post Syndicated from Владислав Севов original https://www.toest.bg/toest-razgovaryame-epizod-7/

Тоест разговаряме – епизод 7

В седмия епизод на видеопоредицата „Тоест разговаряме“ с Михаил Ангелов коментирахме границите и възможностите на съвременната наука – от генетичното редактиране с CRISPR до бъдещето на храните и добива им. Той обясни как новите биотехнологии вече дават реални решения за лечение на тежки заболявания и по-устойчиво земеделие, но същевременно поставят сериозни етични въпроси. Разговорът ни се отправи и към космическите изследвания и завръщането на хората към Луната чрез мисията Artemis II. Обсъдихме как научните пробиви не са чудеса, а резултат от многогодишни усилия, работа, проверки и корекции.

Засегнахме и темата за недоверието към науката, митовете около ГМО и ваксините и защо несигурността е естествена част от научния процес, а не негов дефект. Обобщихме, че писането за наука, също както заниманието с наука, е бавен процес, който изисква търпение, създава условия за натрупване на знания, за критично мислене и разумен обществен диалог.

Гледайте целия епизод в нашия YouTube канал:

Може да го чуете и като аудиозапис в SoundCloud:



След разговора помолих Михаил да отговори тук на още един зрителски въпрос, който ограниченото ефирно време не ни позволи да обхванем:

В следващите десет години как ще се промени начинът, по който отглеждаме храната си и се храним? Предвид все по-големия натиск (основателен) да преминаваме преобладаващо към растителна диета… С други думи, как и къде ще си гледаме зеленчуците и плодовете?

С промените в климата най-вероятно ще има изместване на „традиционните“ култури от едни в други географски зони и преминаване към отглеждане на закрито – било то в оранжерии с използване на слънчевата светлина или в напълно затворени пространства със специализирани осветителни тела. Мисля, че преминаването към отглеждане на растения без почва ще се превърне от сравнително нишово във вече наложително решение.

Отглеждането в изкуствена среда (торене и осветление) има потенциал за по-високи добиви и по-малък риск от загуба на продукцията, което означава и по-високи приходи. Разбира се, органичните продукти ще останат търсени и отглеждането им по традиционни методи ще продължи. Предполагам, че това (особено в дългосрочен план) ще става все по-скъпо поради промените в климата, нуждата от повече пространство за отглеждане на същото количество продукция и труда, свързан с отглеждането им.

Преминаването обаче към растителна диета не е обезателно. Ако успеем да прескочим предубежденията си, в момента има опция да включим в менюто си и протеин от насекоми. Той има значително по-малък екологичен отпечатък и може да предостави достъп до животински протеин на огромен брой хора, които в момента се хранят основно с растения. В още по-оптимистичен план, ако производството на месо от клетъчни култури се наложи по-масово, се създава предпоставка проблемът да се реши в голяма степен, стига потребителите да приемат продукти, сходни с кайма и кренвирши, вместо пържоли.

Каквото и да се случи, по всичко изглежда, че тенденцията земеделието да става все по-технологичен сектор, който се отдалечава от „градината на баба“, ще се засили.

Преди срещата ви помолихме да отговорите на кратката ни анкета. Ето и резултатите от нея:

ГМО е модифициране на гените на даден организъм с цел променяне, премахване или добавяне на външни и/или вътрешни белези.


Михаил Ангелов е биолог, агроном и магистър по растителна защита. От повече от десет години работи в сферата на растителната молекулярна генетика и селекция. Има няколко специализации, последната от които е в един от водещите европейски центрове за растителни изследвания – Института по растителна системна биология (VIB–PSB) към Университета в Гент, Белгия. В момента работи върху докторантура, свързана с абиотичния стрес при растенията. Основните му интереси са възможностите за редакция на генома, предоставени от новите геномни техники (напр. CRISPR), съвременните селекционни подходи, както и производството на различни биотехнологични продукти с помощта на прецизни ферментации.


Тоест разговаряме – епизод 7

Следващата среща на „Тоест разговаряме“ ще бъде с арх. Анета Василева и ще се проведе на живо в YouTube Live на 7 март, събота, от 16:00 ч.


В „Тоест разговаряме“ всеки месец ви срещаме с автори, които познавате добре от анализите или от рубриките им в „Тоест“, но този път ще ги видите и чуете в по-личен и непосредствен формат. Във видеоразговорите, предавани на живо, активно участие имате и вие, нашата публика – със своите въпроси, коментари и включване в тематичната анкета. Водещ на поредицата е Владислав Севов, дългогодишен телевизионен журналист и съосновател на „Тоест“.

Тоест разговаряме – епизод 7

„Тоест разговаряме“ е поредица, подкрепена от Институт „Отворено общество – София“ и съфинансирана от Европейския съюз в рамките на проекта Media Resilience. Изразените възгледи и мнения са само и изцяло на техните автори и не отразяват непременно възгледите и мненията на Европейския съюз, на Европейската изпълнителна агенция за образование и култура (EACEA) или на Институт „Отворено общество – София“ (ИООС). Нито Европейският съюз, нито EACEA, нито ИООС могат да бъдат държани отговорни за тях.

Научни новини: Генни технологии, астронавти, химически фосили и климатични промени

Post Syndicated from Михаил Ангелов original https://www.toest.bg/nauchni-novini-genni-tehnologii-astronavti-himicheski-fosili-i-klimatichni-promeni/

Крачка към съвременните генни технологии в Европа

Научни новини: Генни технологии, астронавти, химически фосили и климатични промени

Регулациите относно намесите в генома на растенията в Европа са сравнително стари и все още третират растенията, създадени с новите геномни техники (НГТ), например CRISPR, като „традиционни ГМО“ въпреки големия обем научни доказателства за тяхната безопасност и еквивалентност на сортовете, получени с конвенционални селекционни подходи. С нарастването на риска Европа да изостане от другите държави, в които тези растения са одобрени, широката научна общност и по-прогресивните земеделски производители очаквано започнаха да настояват за осъвременяване на законите.

Така в средата на 2023 г. Европейската комисия предложи преразглеждане на регулациите, като тогава бяха описани някои основни положения. Накратко, идеята беше генетично манипулираните растения да се разделят в две категории. В първата влизат растения с промени, които могат да се срещнат в природата или да се постигнат с традиционните техники за селекция. Втората включва останалите, които могат да носят ДНК от чужди организми или имат по-големи намеси в генома. Оттогава, освен в науката, прогрес има и в бюрокрацията.

Научни новини: ГМО и глобално затопляне
Да си поговорим за ГМО и глобално затопляне. В случая ще говори Михаил Ангелов чрез своите научни новини. Този път е подбрал две големи теми – за генетичните манипулации и за затоплянето на планетата.
Научни новини: Генни технологии, астронавти, химически фосили и климатични промени

В началото на миналия месец Съветът на Европейския съюз постигна предварително споразумение с Европейския парламент за установяване на нов набор от правила, които да оформят законовата рамка за НГТ.

Според споразумението двете категории растения се запазват и тези в първата ще се разглеждат като еквивалентни на традиционните растения. Както и в предложението от 2023 г., етикети ще се поставят само на семената, от които се отглеждат, но на самите растения, както и на продуктите, получени от тях, няма да има етикет, за да се спази принципът за еквивалентност. Според Съвета това няма да доведе до тежест за селекционерите, но ще позволи на производителите да изключат НГТ от процесите си. Все пак се предвиждат някои изключения за конкретни агрономични принципи. Например толерантността към хербициди, както и отделянето на инсектицидни вещества ще означава автоматично прехвърляне на растенията към втората категория.

Растенията в нея ще бъдат регулирани по-стриктно. Освен семената, етикети ще носят и продуктите, получени от такива растения, като етикетът ще съдържа информация за всички агрономични признаци, в които е имало намеса. Така Съветът цели да гарантира, че потребителите ще имат информация за извършените редакции. Важно решение е да се даде възможност на държавите членки да изберат да не отглеждат растения, получени чрез по-сериозни намеси.

Пречките и надеждите пред CRISPR
Като всеки инструмент, CRISPR може да бъде използван и за спорни цели. Но възможностите, които предлага, са много обещаващи. Някоя от модификациите му или нова подобна система ще бъде в основата на…
Научни новини: Генни технологии, астронавти, химически фосили и климатични промени

Интересно е, че националните органи ще проверяват дали растенията принадлежат към първата категория. За това може би ще се разчита и на организациите, регистриращи новите растения, защото намесите в общия случай са неразличими от случайно настъпили мутации, които се срещат в природата, и от традиционния селекционен процес, което е основата на принципа на еквивалентност. Когато тези растения вече са разпределени в първа категория (например регистрирани като сорт), потомството им няма да бъде проверявано впоследствие, подобно на процедурите за новите сортове в момента.

Една от особено важните теми по отношение на новите регулации е защитата на интелектуалната собственост. Намирането на баланс между различните интереси може да се окаже трудно, но е от изключителна важност за постигане на целта на предложението, а тя е нов подем в развитието на биотехнологичния сектор в Европа. Една от големите тънкости ще бъде да се осигурят равни условия за по-малките компании, така че пазарът да не се консолидира в корпорациите, които имат основен контрол върху него в момента.

Съветът и Парламентът ще създадат експертна група по патентоване, която ще се състои от експерти от всички страни членки, с цел разглеждане на въздействието на патентите. Една година след влизането в сила на регламента Комисията ще публикува проучване на въздействието на патентоването върху иновациите, наличието на семена за земеделските стопани и конкурентоспособността на сектора на растителната селекция в ЕС. 

За финализиране на процедурата предварителното споразумение трябва да бъде одобрено от Съвета и Парламента. Това ще открие много нови възможности пред европейските селекционери, като същевременно ще гарантира безопасността на потребителите.

Неочаквано завръщане

Графикът на астронавтите, които пребивават в Международната космическа станция (МКС), се подготвя изключително стриктно и в него няма много място за импровизации. Наред с всекидневната им програма, датите за пристигане на станцията и тръгването от нея се планират месеци предварително. Въпреки това понякога се налагат промени – например удължаването на престоя на Суни Уилямс и Бъч Уилмор, които прекараха 286 вместо планираните 8 дни поради технически проблеми с капсулата, която трябваше да ги върне.

Научни новини: Титанови сърца, генни редакции, биополимери и една космическа одисея с щастлив край
Както сме отбелязвали, научните новини са по-добрите новини. Този път Михаил Ангелов ни разказва за човека с титаново сърце, за яванските макаци и за възможната нова употреба на целулозата, а за финал имаме щастливия край на историята с космокрушенците Суни Уилямс и Бъч Уилмор.
Научни новини: Генни технологии, астронавти, химически фосили и климатични промени

Промени са настъпвали и в предвидени космически разходки извън станцията вследствие на здравословни проблеми, така че когато NASA първоначално съобщи за отлагане на следващото излизане на астронавтите, нямаше особена тревога за тяхното състояние. От МКС трябваше да излязат двамата американци от екипаж 11 на SpaceX – Зина Кардман и Майк Финк. Не се предвиждаше участие на японеца Кимия Юи и руснака Олег Платонов. 

Но ситуацията бързо се превърна в безпрецедентна, когато на пресконференция ръководителят на NASA Джаред Айзъкман съобщи, че един от членовете на екипаж 11 има нужда от медицински преглед, който няма как да бъде извършен на борда на МКС. От Агенцията запазиха името на астронавта и естеството на проблема в тайна, но Айзъкман го определи като „сериозен здравословен проблем“, уточнявайки, че пациентът „вече [е] стабилен“. Това предизвика спекулации от любителите на Космоса, които започнаха внимателно тълкуване на официалните изявления в търсене на следа какво точно се е случило и с кой астронавт.

Потенциална улика беше чут разговор на Юи, в който той иска да говори с медицинско лице, питайки конкретно за хирург. Но това не даде задоволителен отговор на мистерията, тъй като Юи не бе част от планираните ремонтни дейности извън станцията. От Японската агенция за аерокосмически изследвания (JAXA) също съобщиха, че той е здрав.

Така седмица след съобщението капсулата „Дракон“ с екипажа се приводни успешно в бреговата ивица на Калифорния, близо до Сан Диего. По време на живото излъчване астронавтите изглеждаха в добро състояние, без видими здравословни проблеми. Четиримата прекараха една вечер в местна болница, след което се завърнаха в Хюстън за разбор на мисията и среща със семействата си.

Един от интересните коментари, направени от главния медицински директор на NASA д-р Полк, беше, че според математическите анализи на Агенцията вероятността за подобни събития е средно едно на всеки три години. Дали това, че се случва за първи път в рамките на 25 години, е следствие от доброто общо здраве на хората, подбрани за астронавти, или е чист късмет, не е ясно.

Вследствие на извънредната ситуация с екипаж 11, на станцията остана намален състав от други трима астронавти, само един от които американец. Той трябваше да поеме грижите за всички американски модули – вариантът не е оптимален, но не застрашава нормалното функциониране на МКС. Въпреки това в NASA и SpaceX веднага започнаха да разглеждат възможността за изстрелване на следващите астронавти по-рано от предвиденото в средата на февруари. Те вече са в карантина и се подготвят за пътуване след 11 февруари.

Случилото се показва, че дори и при отлично планиране, с каквото е известна NASA (на борда на МКС има сериозен набор от медицинско оборудване), възникват извънредни ситуации, които не могат да се разрешат в орбита. С оглед на предвижданото засилване на човешкото присъствие в Космоса, здравето на астронавтите ще става все по-важен фактор за космическите агенции. Това беше и едно от нещата, на които обърнаха внимание астронавтите на пресконференцията след завръщането си. 

Стъпка към това е планираната за тази година мисия до Луната – „Артемис 2“, в която четирима астронавти (трима от САЩ и един от Канада) ще обиколят спътника ни, както в мисията „Аполо 8“. Целта е да се изпитат ракетата носител SLS и апаратът „Орион“, в който ще пътува екипажът. Както при ранните мисии „Аполо“, орбитата на „Орион“ ще е на „свободно връщане“ към Земята. Тя има форма на осмица и използва гравитационната сила на Луната, така че дори да възникне проблем с двигателите, капсулата да се завърне на планетата. Плановете са ракетата да бъде изстреляна след началото на февруари, но точната дата все още не е ясна.

Еволюционни изненади

Как и кога са възникнали по-сложните форми на живот, е въпрос, на който най-вероятно няма да получим конкретен отговор. Тъй като става дума за малки организми, които нямат кости или черупки, откриването и работата с техните фосили (или сходни отпечатъци) са изключително трудни. За справяне с проблема са разработени различни подходи, всеки със своите предимства и недостатъци.

Един от тях е търсенето на „химически фосили“ – вещества, които се отделят само от отделен тип организми. Сред най-често използваните са стераните, които са стабилни форми на стеролите (вид липиди, най-известният от които е холестеролът). При определени условия на средата те се запазват в скалните пластове, което дава възможност да бъдат извлечени, а после според тяхната структура да се определи от какъв организъм идват. 

Именно по този начин са открити следи от родственици на роговите водни гъби, живели преди Камбрийския взрив. Потвърждението идва от стерани, съдържащи 30 и 31 въглеродни атома – сравнително редки форми, характерни за този тип водни гъби. Това ги прави едни от най-ранно известните ни животни, като почти сигурно те са живеели в океана. Според авторите на изследването, освен доказателство за съществуването на тези животни още през неопротерозоя, това показва полезността на метода за проследяване на появата и разпространението на животните през епохите.

Научни новини: Генни технологии, астронавти, химически фосили и климатични промени
Снимка: Albert Kok, Източник: Wikimedia / CC BY-SA 3.0

Въпреки че този подход е обещаващ, съществува възможност за получаване на грешни резултати вследствие на замърсяване или изненади в биологията на неизследваните видове. Поради това някои учени предпочитат използването на т.нар. молекулярен часовник. Методът се основава на допускането, че мутациите в организмите се натрупват сравнително линейно и така, като се сравняват ДНК на няколко организма, може да се определи еволюционното разстояние между тях.

Именно по този начин ново изследване ни връща още по-назад във времето в опит да се открие повече информация за еволюцията на ранните еукариотни клетки (тези с обособено ядро). Анализът е извършен върху голям набор геноми, а фокусът е върху разликите между прокариотите (без ядро) и еукариотите. Според получените данни в периода мезоархай – палеопротерозой (между 3 и 2,5 млрд. години) еукариотните клетки вече са съществували, при това със сложен клетъчен апарат. Освен ядро те са имали цитоскелет и различни мембранни структури, през които се е извършвал транспорт на вещества. В по-късен момент те са получили и друг важен органел – митохондриите.

Това са структури, в които протича процесът на клетъчно дишане – при него с помощта на кислород въглехидратите се превръщат във въглероден диоксид, вода и енергия, която организмът може да използва за своите нужди. Те са важен фактор за развитието на по-сложни форми на живот и са популяризирани с фразата „митохондриите са електроцентралите на клетката“.

Към момента е приета „ендосимбионтната теория“, според която митохондриите са едноклетъчни организми, погълнати от еукариотна клетка. Вместо да бъдат „изядени“, те са останали в симбиоза с нея: получават хранителни вещества, а гостоприемникът – значително количество енергия. Въпреки че не е пряко доказана, теорията е подкрепена от много информация. Поредното парче от пъзела идва от това изследване, описващо съществуването на сложна еукариотна клетка, в която се асимилира предшественикът на митохондриите.

Климатичните промени накратко

Температурните рекорди продължават.

Данни от услугата за изменение на климата на европейската програма „Коперник“ показват, че температурите през последните 11 години са най-високите измерени досега, с рекорди през последните три. На първо място е 2024-та, последвана от 2023-та, която е на пренебрежимите 0,01℃ от 2025-та. Очакванията са, че тази година няма да бъде много по-различна и ще продължи тенденцията за затопляне. Сходна е ситуацията и в океаните, които са погълнали рекордно количество топлина в последната година. Това е предпоставка за по-непредвидими промени в глобалния климат, които могат да се изразяват и в по-засилени валежи и необичайни застудявания. Отделените емисии продължават да се покачват въпреки различните мерки, които се предлагат. Част от емисиите най-вероятно могат да се обяснят с растящите електрически мощности, нужни за новите ИИ изчислителни центрове.

Комарите стават все по жадни за човешка кръв.

Откриването на човешка кръв в насекоми, събрани от защитена местност в бразилската джунгла, е изненада. Изглежда, с намаляването на видовия състав в екосистемите насекомите се принуждават да търсят нови източници на ценния ресурс. Това се среща дори при видове, които обикновено предпочитат само един вид – изводът е, че те изпитват трудности да откриват обичайните си гостоприемници. 

Освен до промяна в хранителните им навици това може да доведе и до увеличаване на броя им – за връзката между изсичането на горите и намножаването на маларийните комари се знае от повече от 15 години. Данните ясно показват как нарушаването на хабитатите рязко повишава риска от разпространяване на познати или нови заболявания. 

Според авторите на изследването е нужно да се обособят системи за наблюдение, с които да се следи храненето на комарите, а информацията от тях да се използва за по-добър контрол на популациите им и за дейности по възстановяване на засегнатите екосистеми.

Изненада от Ледената епоха.

В стомаха на млад вълк, попаднал в сибирския пермафрост преди около 14 400 години, е открито парче месо, което според ДНК анализа принадлежи на вълнест носорог. Геномът на носорога показва, че местната популация към момента е била достатъчно голяма и няма признаци за близкородствено чифтосване.

Научни новини: Генни технологии, астронавти, химически фосили и климатични промени
Рисунка на вълнести носорози, открита в пещерата Шове в Южна Франция. Според учените пещерата е обитавана преди повече от 30 000 години. Снимка: Claude Valette Източник: Wikimedia / CC BY-SA 4.0

Липсата на следи от намаляване на популацията най-вероятно означава, че тя е изчезнала сравнително бързо. Времево това съвпада с периода на междинно затопляне Bølling–Allerød (14 700–12 900 години), през който температурите в Северното полукълбо се повишават рязко с около 2–3℃. Това води до съществена промяна и за повечето мамути, както и за северноамериканската мегафауна. Освен чисто техническото постижение да се секвенира геном от остатъци, открити в стомаха на животно, живяло през Ледниковата епоха, изследването показва колко пагубни могат да бъдат резките промени в глобалните температури, особено за видове със специфичен ареал и трудности при адаптирането.


Веднъж месечно Михаил Ангелов – биолог, агроном и любим нърд от нашия екип, ни представя най-интересните скорошни новини от различни сфери на науката и обяснява защо тези постижения са толкова значими за света и човечеството. Или най-малкото – любопитни и забавни.

Научни новини: „Вояджър“, паяжини и регенерация на крайници

Post Syndicated from Михаил Ангелов original https://www.toest.bg/nauchni-novini-voyager-payazhini-i-regeneratsiya-na-krainitsi/

Далечна диагностика

Научни новини: „Вояджър“, паяжини и регенерация на крайници

Програмата „Вояджър“ е най-продължителната мисия на NASA. Далечните сонди все още изпращат информация и ни вълнуват с премеждията си в дълбокия Космос. Макар и да е впечатляващо колко добре се държат двата апарата предвид възрастта си, за съжаление, с напредване на времето състоянието им се влошава и все по-често се налагат намеси от екипа инженери, който работи с тях. В последните няколко месеца към пътешествениците бяха изпратени редица команди, за да осигурят още интригуващи новини.

Апаратите се захранват от специални модули, които превръщат в електрическа енергия топлината, отделена при разпада на радиоактивни елементи (в случая плутоний). Въпреки че мощността им не е особено голяма, те са предпочитани за подобен тип мисии, тъй като са надеждни поради сравнително простата си конструкция. Годишно източникът губи около 4 вата, което не е пречка за основната им мисия, приключваща в края на 1989 г. Но удължаването ѝ налага постепенно изключване на различни научни инструменти поради намаляването на енергийните ресурсиминалата година това стана с уреда, измерващ количеството и посоката на заредени частици (плазма) на „Вояджър 2“.

В началото на март бяха изключени още два инструмента – измерващият космически лъчи на „Вояджър 1“ и засичащият заредени частици с ниска енергия на „Вояджър 2“. И двата са поставени на платформи, които се въртят, така че да осигуряват пълно измервателно поле. Задвижващите ги мотори са изпитани да издържат 500 000 стъпки – достатъчно, за да осигурят нормална работа на инструментите до прелитането на „Вояджър 2“ покрай Сатурн през август 1980 г. Към момента на изключването си те вече са направили над 8,5 млн. стъпки – 17 пъти повече от предвиденото.

Тъй като данните, които събират апаратите, са уникални, екипът на NASA се опитва да отложи изключването на научните инструменти, но за съжаление, това е неизбежно. През идната година всеки от двата апарата ще загуби по още един инструмент, което би трябвало да им даде възможност да функционират с поне по един аналитичен уред и след 2030 г.

От дълбокия Космос пристигат и добри новини. Сондите са оборудвани с няколко набора двигатели, които променят ориентацията им в пространството. Освен за изпълняване на преките задачи на апаратите това е важно и за точното им позициониране и комуникация със Земята. Два от наборите двигатели позволяват завъртането им, така че сондите да могат да държат навигационните си инструменти насочени към конкретно избрани звезди. Поради проблем с нагревателните им елементи основните двигатели на „Вояджър 1“ спират да работят през 2004 г., но специалистите не го отчитат като особен проблем, защото резервните функционират нормално и навигационните маневри могат да се поверят на тях.

Това от своя страна води до други проблеми, които тогава може би са преценени като прекалено далечни. С времето по тръбите, провеждащи гориво до двигателите, се натрупват остатъци, които стесняват диаметъра им и могат да доведат до пълно запушване. За забавяне на процеса екипът на NASA започва да използва и другите двигатели на апарата – те нямат възможност за завъртане на апарата около оста му, но поне могат да правят малките корекции, нужни за насочване на антената към Земята. С едно от последните обновявания на софтуера беше разредено и времето между включването на двигателите.

Все пак рискът „Вояджър 1“ да остане без завъртането си кара инженерите да направят нов анализ на проблема с нагревателите на основния двигател. Оказва се, че най-вероятно ситуацията е тривиална – някой от ключовете, които контролират захранването на двигателите, е в грешна позиция.

Но проверяването на хипотезата не е толкова лесно. За целта двигателите трябва да бъдат активирани, след което да започне работата по проучване и евентуално по възстановяване на нагревателите. Това крие известен риск – ако сондата се отклони значително, автоматичната система за навигация ще включи двигателите, което би довело до малка експлозия, в случай че нагревателите не функционират. Ситуацията се усложнява и заради планов ремонт на голямата антена в Австралия, с помощта на която се осъществява комуникацията с апарата. Тя почти няма да работи до май 2026 г. Поради това инженерите искат основните двигатели да са активни за краткия прозорец през август, когато ще получат данни от „Вояджър 1“ и ще могат да изпратят нови инструкции до апарата.

Така в края на март специалистите активират основния двигател и изпращат командите, които би трябвало да включат нагревателите. Два дни по-късно (сондата е на почти един светлинен ден от Земята) получават телеметрични данни, които показват повишаване на температурата в нагревателите.

Това е поредният случай на почти невероятно спасяване на някоя от системите на дълголетните апарати и показва изключителното ниво на инженерите, които са ги проектирали навремето, както и на тези, които работят с тях в момента. Може да се надяваме, че въпреки зачестяващите премеждия двете сонди ще продължат да носят вести от дълбокия Космос. Към момента се предполага, че радиоактивната батерия на „Вояджър 1“ ще издържи още около 10 години, но ако съдим по досегашния си опит с „Вояджър“, е много вероятно да ни очакват изненади.

Футуристични влакна

Паяжините са впечатляващи творения, които освен насекоми пленяват и нашето въображение със своята изящност. Те са продукт на сложен биологичен процес, започващ със синтеза на специализирани протеини в жлезите на паяците. От тези протеини после се предат влакна със специфични свойства – здрави и еластични за основата на мрежата; леки – използвани за парашут; и лепкави – за улавяне на плячка. Поради изключителната си якост, по-висока от тази на стоманата, някои от нишките имат огромен потенциал за приложение в редица индустрии. Плат, изработен от тях, би могъл да бъде използван за най-различни бронезащитни изделия; въжета, изплетени от тях, ще са по-леки и по-здрави от стоманените. Медицината също е поле, което би имало полза от подобен материал – от нишките може да се направят конци, сухожилия или специални марли и бинтове.

Пречка за разгръщане на този потенциал е липсата на масово производство на паяжина. Паяците са изключително трудни за отглеждане, а събраната паяжина е в малки количества. За справяне с това през годините са предлагани различни решения, като може би най-куриозното беше генетично модифицирани кози, които експресират в млякото си протеините, изграждащи паяжините. Тъй като отделянето на протеините е сложен процес, а и обществената реакция беше доста критична, този подход не се наложи. Интересен вариант е представен в публикация от 2023 г. – създаване на копринени буби, които отделят чисти паяжинови нишки, готови за употреба.

Изненадващото е, че доскоро нямаше разработена процедура за генетична манипулация на паяци. Най-вероятно това се дължи на по-трудното им отглеждане и манипулиране. Наскоро германски учени публикуваха статия за първите генно редактирани паяци. Подходът, на който са се спрели, е инжектирането на конструкта, носещ CRISPR/Cas9, в хемолимфата на неоплодени женски паяци. По този начин той се разпространява в тялото им, достига ооцитите (развиващите се женски полови клетки) и редактира техния геном. След чифтосване с мъжки паяк част от потомството на женската би трябвало да носи редактираните гени.

За да изпита работата на системата, екипът първо се спира на по-лесната модификация – нарушаване на функционирането на добре известен ген. Избран е sine oculis – ген, регулиращ развитието на очите на паяците, тъй като загубата му не е летална за животните, а полученият фенотип (промяната във външния вид) е лесно забележима. След извършване на процедурата в потомството на редактираните майки се наблюдават различни степени на проблеми с развитието на очите – от грешна форма до пълната им липса. С това учените доказват, че sine oculis наистина е регулатор на генната каскада, отговорна за формирането на очите. Интересното е, че при всички редактирани паяци лещата на очите присъства, което означава, че тя е под контрола на друг регулаторен ген. Промените показват също, че системата за редакция работи и може да се приложи и за други намеси в генома на паяците. След като доказват това, учените започват по-вълнуващата част от работата си – вмъкването на нов ген.

Научни новини: „Вояджър“, паяжини и регенерация на крайници
Паяк от вида Parasteatoda tepidariorum (обикновен домашен паяк), който е във фокуса на изследването и произвежда флуоресцираща червена светлина нишка, след като е бил генно редактиран с CRISPR-Cas9. Изображение: University of Bayreuth

Съставът на нишката, която служи за изграждане на опорните и радиалните нишки на паяжината, е добре проучен. Главните компоненти са два протеина – единият с високо, а другият с ниско съдържание на аминокиселината пролин, като първият придава еластичност, а вторият – здравина. И двата протеина в краищата си имат участъци, които нямат участие във функцията на нишките, а служат за определяне на тяхната структура по време на съхранението и изплитането им. Именно там е подходящо да се вмъкне парче ДНК, което не нарушава тази функция, но добавя белтъчна структура, способна да флуоресцира в червен цвят.

След третиране на женските паяци и получаване на потомство учените виждат, че експериментът им е успешен – нишките, които изплитат паяците, са белязани с добавеното багрило. При дисекция на паяците флуоресценцията се наблюдава и в самите жлези, отговорни за произвеждането на този тип нишки. Още повече, редакцията е стабилна и присъства и в потомството на модифицираните паяци, което също носи червения протеин.

Положителните резултати означават, че вече има ясен протокол за генетични редакции на паяци, което отваря възможности както за фундаментални, така и за по-практично насочени проучвания. Например промяната на свойствата на паяжината може да бъде основа за нови материали или технологии. Въпреки че звучи леко фантастично, сходно приложение е вмъкването на багрила в нишките на копринените буби, за да се премахне нуждата от допълнително оцветяване на платовете, което често се прави с токсични химикали и голямо количество вода. Стъпка към това е проект, започнал в началото на месеца. Целта е да се създаде термостабилен син хромопротеин, базиран на хромопротеина от корала обикновена актиния, който може да се използва за багрене на тъкани.

Тайните на аксолотлите

Способността на саламандъра аксолотъл за възстановяване на наранени органи е впечатляваща – симпатичните животни могат да регенерират сложни части от тялото си, например опашка и крайници. За процеса вече се знае много – първо се образува т.нар. бластема от дедиференцирани клетки (клетки, които се връщат към състояние на стволови и могат да се развият като всеки вид тъкан). След това от бластемата се формира „пъпка“, от която започва да израства крайникът, като за това е важно участъкът да има запазена нервна тъкан. А за координацията на тези стъпки отговаря молекула, производна на витамин А (ретиноева киселина).

Но как бластемата „разбира“ точно коя част от крайника трябва да пресъздаде? На този въпрос отговаря ново изследване, публикувано в журнала Nature Communications.

Текущата хипотеза е, че в различните участъци на крайниците се произвеждат различни количества ретиноева киселина, което насочва клетките на бластемата към това коя част от крайника липсва. Оказва се, че предположението е донякъде вярно – концентрацията на киселината наистина определя развитието на конкретни части, но това става не чрез промени в синтезираното количество, а с разграждането ѝ в различна степен. 

Клетките в крайната част на регенерирания орган (например китката) произвеждат много голямо количество от ензим (CYP26B1), който има способността да разгражда ретиноевата киселина. Обратно – в раменния пояс ензимът почти не се произвежда. Така чрез разрушаването на киселината се създава градиент на концентрацията ѝ от рамото към китката, който помага на стволовите клетки да „се ориентират“ в пространството.

Научни новини: „Вояджър“, паяжини и регенерация на крайници
Изображение, показващо развитието на бластемата на аксолотъл в крайник. Публикувано е в изследване от 2015 г. Източник: Wiley Online Library

За да потвърдят откритието си, учените провеждат прост експеримент. След ампутация на крайника на саламандъра при китката, участъкът се третира с медикамента таларозол, който има свойството да нарушава работата на ензима CYP26B1. Така ретиноевата киселина не се разгражда и може да се натрупа в големи количества. И наистина, животните регенерират от китката си цял крайник, сякаш са го загубили от рамото си. Това ясно доказва, че действието на ензима и количеството ретиноева киселина ръководят процеса на възстановяване.

Опитвайки се да вникнат по-дълбоко в молекулярните механизми на регулация на процеса, учените разглеждат нивата на експресия на различни гени в крайника на земноводните и установяват, че с покачване на нивата на ретиноева киселина се повишава и активността на гена SHOX (short-stature homeobox gene). Той се среща и при човека и също отговаря за регулацията на крайниците, като при нарушения на функцията му се уврежда развитието им. Това се наблюдава и при аксолотли, в които генът е изключен с помощта на CRISPR. „Дланите“ се развива нормално, но горната част на крайника е скъсена. Интересното е, че присъствието на гена не е нужно за изграждането на нов крайник.

Откритието е важна стъпка към разплитането на мистерията как протича и как се регулира процесът на регенерация, въпреки че остават много отворени въпроси. Например от това изследване не става ясно какъв е механизмът за засичане на по-ниска концентрация на ретиноева киселина – SHOX се експресира предимно в основата на крайниците.

Към момента основната спънка пред регенерацията на органи при хора е създаването на бластема. Но ако учените успеят да открият начин да го направят възможно, познаването на процесите, които протичат след това, ще бъде безценно. Ето защо всеки пробив в опознаването на сигналните пътища, които ги регулират, е окуражаващ.

Научни новини: По-сладки домати, спасение за бананите, CRISPR терапии и отърваване от „вечните химикали“

Post Syndicated from Михаил Ангелов original https://www.toest.bg/nauchni-novini-po-sladki-domati-spasenie-za-bananite/

Вкусни домати

Научни новини: По-сладки домати, спасение за бананите, CRISPR терапии и отърваване от „вечните химикали“

Оплакването от „пластмасовите домати“ е често срещано и добре познато на учените, които се занимават със селекция на любимия на мнозина плод. Истината, която стои зад популярността на този тип сортове, е възможността да бъдат транспортирани и съхранявани за дълги периоди, без търговският им вид да пострада значително. Вкусните меки домати се нараняват лесно и се развалят бързо, което носи значителни щети на производителите и търговците.

Създаването на нов сорт е фин процес, при който се балансират много фактори – вкусови качества, добив, размер на плодовете, транспортабилност, устойчивост на различни заболявания. Тъй като те са свързани в сложна мрежа от биохимични взаимодействия, обикновено промяната в един от тях води до други промени, които могат да бъдат и нежелани. Пример за това са гените за устойчивост на патогени, които често влияят негативно на вкуса.

Отрицателен ефект има и подборът на растения с по-големи плодове – те съдържат значително по-малко захари, поради което повечето чери сортове са по-сладки. Учените могат да насочат селекционния процес към повишаване на захарността, но тогава пък спада добивът. Растенията имат ограничено количество енергия и могат да го насочат към различни процеси, определени от молекулярни механизми, които са се развивали в продължение на милиони години. Но с малка намеса в генома им това не може да се промени.

В основата на синтеза на захари стои магията на фотосинтезата. При този процес, най-общо, от въглеродния диоксид във въздуха, от водата и от слънчевата енергия се получава глюкоза, която може да бъде модифицирана до фруктоза, а при свързването на двете се получава захарта, позната ни от белите кубчета – захарозата. Растенията я използват за транспорт и съхранение на енергия (например захарното цвекло я концентрира в кореноплода си) и с помощта на специални ензими я превръщат обратно в по-прости захари, които мога да използват за метаболизма си.

С промяна на тези процеси китайски учени успешно са създали по-сладки домати. Те са открили два протеина, които се експресират основно в плодовете на доматите и унищожават един от ензимите, който може да разгради захарозата до глюкоза и фруктоза. С помощта на CRISPR/Cas9 гените за синтеза им са инактивирани, което води до значително увеличение на количеството захари в плодовете. В едно от растенията нивата на глюкоза са се повишили с 35%, а на фруктозата – с 30%. Най-впечатляващото е, че размерът на плодовете не се е повлиял от редакциите. Негативно е било отражението върху броя и масата на семената, но не и върху способността им за покълване, което може дори да се хареса на потребителите и не създава пречка за селекционерите. По-високото съдържание на захари ще бъде полезно и за сортове, които се използват за преработка, тъй като намалява необходимостта от добавяне на захар в сосове и други продукти.

Хипотезата на учените е, че двата манипулирани гена отговарят за преразпределението на енергия между плода и семената по време на узряване. Това откритие може да се окаже важно, тъй като е много вероятно подобен механизъм да присъства и в други плодове. Експериментът показва как понякога с минимална намеса може да се получат впечатляващи резултати.

Да спасим бананите

Бананът е интересна култура, която има голямо икономическо значение. Поради наличието на семена в дивите видове, сравнително рано в селекционния процес са подбрани сортове, които са триплоидни – те носят три копия на генома, за разлика от по-традиционните две. Полиплоидността е често срещана при растенията и обикновено е търсено качество за културните растения. Но когато броят на копията е нечетен, растенията са стерилни и или не произвеждат семена, или семената са изключително малки.

Принципно липсата на семена не е проблем, тъй като повечето овощни култури се размножават вегетативно, като по този начин се гарантира, че характеристиките на плода ще се запазят. Но тъй като всички растения на практика са едни и същи (клонинги), те са много по-чувствителни към заболявания. Обикновено в процеса на половото размножаване характеристиките на майчиното и бащиното растение се разпределят в потомството и така то е хетерогенно: някои от растенията са по-чувствителни, а други – по-устойчиви и в еволюционния процес видът е по-устойчив на неприятели и патогени.

Именно това налага драстична промяна в производството на банани през 50-те години на миналия век, когато гъбата Fusarium oxysporum f.sp. cubense, причинител на панамската болест (фузарийно увяхване) завзема големите плантации по света. Масовият тогава сорт „Гро Мишел“ (Gros Michel) е изключително чувствителен към заболяването, което прави мащабната му култивация невъзможна. Поради тежките последствия от заболяването и премахването на „Гро Мишел“ от плантациите, за него понякога се говори като за „изчезнал сорт“, но всъщност той все още може да се открие в редица тропически страни. 

Решението е въвеждането на нов сорт – „Кавендиш“ (Cavendish), който поради устойчивостта си на патогена бързо се налага като основен и покрива над 90% от бананите, отглеждани за износ. Освен необходимостта от подмяна на насажденията, преходът има и други негативи – общоприетото мнение е, че вкусът на новия сорт не е толкова добър, колкото на „Гро Мишел“.

50 години по-късно ситуацията се повтаря – нов щам на патогена (tropical race 4, Foc TR4) успява да преодолее защитите на „Кавендиш“ и застрашава масовото производство. За проблема се говори от доста време и за съжаление, към момента няма окончателно решение за справяне със заболяването. Въпреки това не бива да гледаме прекалено драматично на случващото се, тъй като учените работят усилено върху различни подходи за контрол на заболяването.

Благодарение на скорошно изследване знаем повече за произхода и метода на действие на патогена. След сравнителен анализ на генома на 36 щама се оказва, че той не е произлязъл от поразилия „Гро Мишел“, а има собствена еволюционна история. Установено е също, че има специфични гени, които служат както за синтез, така и за детоксификация на азотен оксид. Изследователите не са сигурни каква функция има този механизъм, но е ясно, че е отговорен за високата патогенност на щама, тъй като при премахването на въпросните гени патогенността значително намалява.

Работи се и по създаването на нови сортове. Вече има няколко генетично модифицирани сорта, които показват добра устойчивост. Първото полско изпитване на един от тях е направено още през 2017 г., като за създаването му са използвани два различни гена за устойчивост. Единият от тях (RGA2) е открит в див банан, устойчив на патогена, а другият (Ced9) е трансген, изолиран от нематоди.

Въпреки трудностите при подхода на класическата селекция, немски учени в сътрудничество с компанията „Чикита“ и други партньори са успели да създадат нов сорт – Yelloway One, който освен на фузарийното увяхване е устойчив и на черната сигатока – друго икономически важно заболяване. За улесняване на процеса са използвани и модерните геномни технологии за секвениране и молекулярни маркери. Сортът все още е прототип и се отглежда само в оранжерии, но се планират пилотни изпитвания във Филипините и Индонезия – региони, силно засегнати от заболяванията. Интригуващото е, че той е част от по-мащабен план (т.нар. инициатива Yelloway) за създаване на множество нови сортове, които не отстъпват на „Кавендиш“, но са устойчиви и по-важното – внасят генетично разнообразие в сортовия състав. Така рискът отново да се озовем в сегашната ситуация ще намалее значително.

Интересно решение идва и от Антарктика. Събирайки проби от мъхове и лишеи от студения континент, изследователи са успели да изолират значителен брой актиномицети. Това са бактерии, чиито колонии образуват нишки, подобно на гъбите. Те се срещат повсеместно, дори и в човешкия микробиом, и са важна част от почвената микрофлора, отговорна за разграждането на органични вещества. Част от изолатите проявяват антигъбна активност, като в девет от тях тя е особено висока. При изпитвания върху различни гъбни патогени те се оказват много подходящи за контрол на Foc TR4. Когато патогенът се третира с екстракт от актиномицетите, растежът му се потиска и впоследствие клетките му загиват. Методът показва висока ефективност и се приема за екологосъобразен, което го прави много добро допълнение в арсенала срещу заболяването.

След появата на Foc TR4 бяха публикувани множество сензационни материали как едва ли не бананите ще изчезнат като продукт. Въпреки трудностите, които заболяването поставя пред фермерите, това е малко вероятно, тъй като много учени работят по проблема. С напредъка на науката и появата на нови технологии, сега има доста по-разнообразни методи, които могат да се приложат, някои дори с потенциал за намиране на трайно решение.

Първата CRISPR генна терапия в действие

Casgevy – генната терапия срещу сърповидноклетъчна анемия и бета-таласемия, за която сме разказвали, вече се прилага на пациенти извън клинични проучвания. В съобщение за инвеститорите Verex – компанията, разработила продукта, е обявила приходи от 2 млн. долара от един пациент, който е получил терапията в третото тримесечие на годината.

Към момента има 45 одобрени клиники в обширен географски периметър (САЩ, Канада, Обединеното кралство, Европа, Близкия изток), които могат да извършват процедурата. Освен споменатия пациент още 40 са в началото на процеса – от тях са събрани стволови клетки, които ще бъдат редактирани. Очаквано, процедурата не е бърза, нито лесна и ще отнеме време, преди да бъдат получени данни от терапията. След извършване на редакцията пациентите минават курс на химиотерапия, при който се премахват стволовите клетки в костния им мозък. Тогава редактираните стволови клетки се връщат в пациента и започват да произвеждат хемоглобин F, който намалява симптомите на заболяването.

Според компанията терапията се приема много добре от пациентите и лекарите и се очаква тепърва броят на клиентите да расте, като са предоставени данни, че в САЩ и Европа има около 35 000 пациенти, които могат да бъдат третирани с Casgevy, и допълнителни 25 000 в Саудитска Арабия и Бахрейн. Предстои да разберем дали очакванията ще бъдат оправдани, защото лечението не е евтино и лесно – процесът на извличане на стволовите клетки не е приятен, а химиотерапията крие редица рискове. Въпреки това новината е радостна, защото показва, че този вид генни терапии не са научна самоцел, а имат пряк ефект върху живота на хората.

Пречистване от „вечни химикали“

Пер- и полифлуороалкилираните вещества (PFAS) са широко разпространени химикали, които се използват в множество продукти – незалепващи съдове (тефлонът е най-популярният от тях), най-различни водоустойчиви тъкани, кабелни изолации и дори в козметични продукти (очна линия, червило, спирала). Тъй като съдържат въглерод-флуорни връзки, които са едни от най-силните, те се разграждат изключително трудно, поради което често биват наричани вечни химикали. Някои от тях вече са забранени в ЕС, а забраната на други е обект на дискусия в момента. След като попаднат в човешкото тяло, те имат способността да причинят редица здравословни проблеми, като ракови заболявания, засягащи различни органи, проблеми с хормоналния баланс, понижен фертилитет, проблеми в когнитивното развитие и др. Това ги прави изключително опасен замърсител на околната среда.

Пречистването на вода от PFAS не е лесно и изборът на подход зависи от дължината на веригата на химикалите. Със забраната на молекулите с по-дълга верига, основните замърсители в момента са късите и ултракъсите PFAS. Нова разработка показва обещаващи резултати за премахването им и разкрива потенциал за широкомащабно приложение за третиране на отпадни води. Екипът вече има разработка за пречистване с помощта на метод, наречен електросорбция, при който адсорбцията се стимулира чрез подаване на електричество, но той не е ефективен за ултракъсите PFAS.

За справяне с този проблем в процеса се добавя стъпка на редокс електродиализа – метод, който се използва в обезсоляването на вода. Пробивът настъпва, след като учените установяват, че молекулите с много къси вериги се държат сходно на солевите йони във воден разтвор. Допълнителна иновация е използването на мембрани за нанофилтрация. Те са по-евтини от класическите йонообменни мембрани и за разлика от тях могат да бъдат почиствани чрез пропускането на електричество през тях. След подбиране на методите за пречистване остава екипът да се справи с предизвикателството как в едно устройство да се извършат електросорбцията, електродиализата и електрохимичната оксидация, която унищожава вечните химикали.

Създаденият прототип показва висока ефективност – постигнато е премахване на замърсяването между 76 и 100% в зависимост от типа и дължината на молекулите. Наред с премахването на PFAS, устройството е показало и добра ефективност при обезсоляване на водата, което значи, че може да се използва за едновременно третиране и на води с по-сложна смес от замърсители.

Сега пред учените стои въпросът как могат да увеличат мащаба на устройството, така че да може да се използва извън лабораторията. Това би било от изключителна полза за новите фабрики за производство на полупроводници, които ще работят в САЩ като следствие от указа на американския президент Джо Байдън за създаване на нови мощности в страната с цел намаляване на зависимостта от фабриките в Тайван. Това е стратегически проект за САЩ и първите индикации са добри – преди месец в завода на TMSC в Аризона бяха получени добиви, които са с около 4% по-високи от тези в Тайван.

Новите технологии и молекули обикновено решават много проблеми, но от време на време се оказва че създават нови, които понякога са по-големи. PFAS са изключително полезни, тефлонът е един от „магическите“ материали на XX век, но колкото повече научаваме за тях, толкова повече разбираме, че употребата им трябва да бъде одобрена само след качествена преценка на риска.

Научни новини: Хипоалергенни котки, чревен микробиом, хитри видри и ванилия за разкош

Post Syndicated from Михаил Ангелов original https://www.toest.bg/nauchni-novini-hipoalergenni-kotki/

Хипоалергенни котки

Научни новини: Хипоалергенни котки, чревен микробиом, хитри видри и ванилия за разкош

Основна задача на имунната ни система е да ни предпазва от неприятели. Но понякога тя действа прекалено агресивно и се активира при попадането на дори безвредни за нас частици и субстанции в организма ни. Тези алергични реакции се изразяват с различни по сила и вид симптоми, някои от които животозастрашаващи. В общия случай алергичните реакции се третират с медикаменти, които пациентът приема. С все по-интензивното прилагане на генни редакции с помощта на CRISPR възможностите за терапия предлагат и изместване от пациентите към самите източници на алергените, ако те са от растителен или животински произход.

Счита се, че около 10–15% от хората имат алергия към котки, която се проявява с различни симптоми – от възпаление на лигавиците до астма. Основният им алерген е Fel d 1 – протеин, който се отделя в слюнката и мастните жлези на животните. Въпреки че някои породи отделят по-малко от него (например бенгалските, ориенталските късокосмести, сибирските котки и др.), в повечето случаи те също успяват да провокират алергичен отговор и няма напълно хипоалергенни котки. Точната функция на протеина не е известна, но учените са открили сходство със защитен токсин, отделян от яванското дебело лори, и протеин при мишките, който участва в подбора на партньор.

През годините са правени редица опити за потискане на този ген. Първоначалната стратегия е използването на антитела, които котките приемат с храната. Резултатите от това са обещаващи, но такъв тип „хранителни добавки“ са скъпи и котките трябва да ги приемат постоянно. Преди две години екип описа възможността за нарушаване на синтеза на Fel d 1 с помощта на CRISPR в тъканна култура. Логичното продължение на това е създаването на първите генно редактирани хипоалергенни котки, описани в публикация от началото на 2024 г.

Използвайки CRISPR, учените първо са направили ембрионални клетки, в които е проведена редакцията, пречеща на котките да синтезират алергена. След това тези ембриони са имплантирани и от тях са получени две котета – мъжко и женско. Мъжкото (Heavy) е „мозаечно“ – носи два типа редакции в гена. Женското (Haemi) е хетерозиготно: единият алел на гена е редактиран, а другият – не. Въпреки че редакцията е непълна, и двете животни отделят по-малко количество от протеина в сравнение с нередактирана котка. При Heavy резултатът е по-слаб – седем дни след като котките са изкъпани, нивата са почти сходни с тези при нередактираната котка. Разликата в Haemi е осезаема, понеже спадът е почти осем пъти в слюнката ѝ и почти шест пъти по козината.

Но най-драстична е разликата в сина им, хомозиготния Alsik, в който спадът е над 98%. Според учените алергенът, който откриват по него, може да е пренесен от нередактираните котки, тъй като всички животни са отглеждани в обща стая, симулираща нормален дом. Именно поради това екипът обявява, че е създадена първата хипоалергенна котка. За допълнително потвърждение на това Alsik е клониран, като и неговият клонинг Alsik C проявява същите качества и според генетичен анализ е идентичен с „родителя“ си. Авторите отбелязват, че редактираните котки, както и клонингът са здрави и активни и към момента нямат видими симптоми.

Преди да бъдат предложени на пазара, ще трябва да се проведе и клинично изследване, при което да се проследи отговорът на алергични пациенти. Първоначалните резултати изглеждат изключително обещаващи и най-вероятно, ако не се появи скрит здравословен проблем, любителите на котки ще могат да се радват на модерните си четирикраки приятели. Засега не е ясно как подобни животни ще бъдат регулирани, но със сигурност интересът към тях ще бъде висок, тъй като котките са едни от най-популярните домашни любимци.

Здрав корем – здрава глава

Ние сме гостоприемници на множество микроскопични обитатели, въпреки че мисълта за това е малко смущаваща. Най-голям брой от тях живеят в храносмилателната ни система – чревният микробиом. Това са множество микроорганизми, които населяват червата ни и ни помагат да усвояваме по-пълноценно храната, която приемаме.

Влиянието на микробиома върху психичното здраве е известен феномен. Един от предполагаемите механизми е по линия на разнообразието на видове и баланса между тях. Изпитанията на ефекта от евентуален дисбаланс при хора са трудни и обикновено се използват животински модели. Един от подходите е съществуващата микрофлора да се премахне с помощта на широкоспектърни антибиотици, след което животните да бъдат захранени с определени микроорганизми.

Интересно изследване е прехвърлянето в плъхове на посевки от пациенти с клинична депресия и от хора без оплаквания. Седмица след трансплантацията гризачите от първата група започват да показват признаци на влошено психично здраве – анхедония и тревожност. Забелязани са промени и в нивата на триптофан – една от незаменимите аминокиселини, прекурсор на серотонина, т.нар. „хормон на щастието“. Нарушенията на този метаболитен път са свързани с различни психични разстройства, като клинична депресия, биполярно разстройство и шизофрения. Авторите отбелязват, че между човека и плъха не може да се направи пълен паралел, но все пак експериментът е показателен за влиянието на микрофлората върху психичното ни състояние.

Нова публикация показва, че освен върху настроението, чревният микробиом може да има ефект и върху поведението ни. В случая експериментът е проведен с доброволци от германски университет. След като участниците са разделени в две групи за установяване на базово ниво, те се включват като приемащи в „игра с ултиматум“. В нея има двама участници – предлагащ и приемащ. Предлагащият има възможност да избере как да раздели определена сума (в изследването са 10 евро) – например да задържи 7, а приемащият да получи остатъка от 3. Ако приемащият се съгласи, двамата получават съответната сума и играта приключва, но ако откаже, тогава и двамата не получават нищо.

В продължение на седем седмици след провеждане на този първи рунд двете групи получават или достъпен на пазара продукт, съдържащ пре- и пробиотик, или плацебо. Резултатът при повтаряне на играта е изненадващ – първата група е станала по-склонна да отхвърли предложение, което ощетява участниците.

Промени има и в нивата на тирозин – прекурсор на невротрансмитера допамин. Така се прави връзка между нивата на триптофан и тирозин. Предишни изследвания са показали, че съотношението между серотонин и допамин има влияние върху вземането на решения в социален аспект, включително и прилагането на алтруистично наказание, както в случая на отхвърлянето на предложението в играта с ултиматум.

Установяването на пълното значение на тези взаимовръзки най-вероятно ще отнеме дълго време, но вече е ясно, че освен чрез блуждаещия (вагусен) нерв към централната нервна система се предава информация и чрез химически сигнали, върху които чревната ни микрофлора има учудващо голям ефект.

Хитри видри

Използването на инструменти не е явление, което се среща само при хората. Освен при по-близките ни примати това се наблюдава и при други бозайници, както и при птици, главоноги и др. Понякога животните си служат с тях за подслон или игра, но в повечето случаи е за по-лесно набавяне на храна.

Морските видри имат богата диета, като едни от любимите им храни са морски охлюви и таралежи – вероятно защото при тях лесно се достига до меките части. Но с промяната на климатичните условия популациите на тези видове понякога спадат рязко и на видрите им се налага да се хранят и с друга плячка. Това обикновено са раци, различни видове миди и малки охлюви, чиято черупка е по-твърда и създава известен проблем, тъй като при отварянето им видрите могат да наранят зъбите си. Ако зъбите им се износят или счупят, се създава сериозна опасност за животните – не могат да се хранят и са застрашени от гладна смърт.

Използването на камъни като наковалня или чук за отваряне на черупки е добре известно при видрите. Те дори имат специални „джобове“ под мишниците си, в които пазят любимите си камъни, докато се придвижват или хранят, за да са свободни и двете им ръце. За да разберат повече за това поведение, екип от учени и доброволци проследява 196 радиомаркирани видри в Калифорния.

Оказва се, че женските видри по-често използват инструменти. Според изследователите причината е, че са по-малки и по-трудно се справят с по-твърдите черупки. Така те успяват да се хранят с до 35% повече твърда храна, отколкото мъжките в същата популация. Това им дава предимство, защото диетата им е по-разнообразна и могат да се хранят по-обилно – обикновено изяждат около 25% от теглото си дневно. Бонус за дамите е, че зъбите им са в по-добро състояние, отколкото на мъжките.

За съжаление, популацията на тези видри в Калифорния е застрашена и се състои от около 3000 индивида. Те играят важна роля в регулацията на видовия състав и контролират популацията на морските таралежи. Хубавото е, че обикновено майките учат малките си да използват инструменти, така че най-вероятно поведението им ще продължи да се разпространява. Учените се надяват това своеобразно технологично развитие да помогне на видрите да се справят с променящата се диета и да започнат да увеличават броя си.

С аромат на ванилия

Ванилията е един от най-популярните аромати и се използва изключително широко в кулинарията и парфюмерията. Зад това ухание се крие молекулата ванилин – органично вещество, което се среща най-често в орхидеята Vanilla planifolia.

Тъй като естественият добив на ванилин от растението покрива много малка част от необходимите количества, съединението от дълго време се произвежда от химическата индустрия. В началото на миналия век като основен подход се налага преработката на остатъци от производството на хартия. При превръщането на дървесината в целулозната маса, от която по-късно се прави хартията, се получава течност с високо съдържание на лигнин. С помощта на меден катализатор лигнинът може да се окисли до ванилин.

Процесът е популярен до 70-те години на миналия век, когато е заменен от пряк химичен синтез от гваякол – вещество, което се среща и в природата, но като суровина се произвежда от петрол. В прехода има известна ирония – употребата на медни катализатори налага скъпа последваща обработка на продукта и отпадъците от производството, така че преминаването към нефтени суровини в случая се приема за по-екологично.

Интересно е да се отбележи, че в Норвегия все още има производство по старата технология. Една от причините е в потенциално по-плътния аромат, който би могъл да има ванилинът в този случай, тъй като не може да се пречисти напълно и в него остават малки количества примеси. Другата е, че според производителя има потребители, които биха избрали техния продукт, защото не се използва петрол.

Потенциално решение за проблема с обработката на отпадъците е предложено в началото на миналата година – замяната на медния катализатор с електричество, което прави технологията много по-екологична. Допълнителна полза е употребата на отпаден продукт, който обикновено се изгаря като източник на енергия. За получаване на ванилин той се обработва с натриева основа и карбонат и се пропуска електричество, което катализира реакцията, като добивът достига до 6% от вложената суровина. Понеже и двата химикала се използват за направата на хартия, производството на ванилин може да се включи в съществуващите фабрики и по този начин да се създаде кръгово производство.

Все пак търсенето на естествен ванилин продължава да е високо, тъй като неговият вкус и аромат се смятат за най-добри. Отглеждането на повече растения е непрактично, а и скоро може да стане невъзможно поради промените в климата. Това кара група японски учени да се опита да използва биосинтетичния път, срещан в природата.

До момента този процес е неуспешен – ензимът, отговорен за превръщането на феруловата киселина във ванилин, има изключително ниска активност извън растенията, което води до пренебрежими добиви. За преодоляване на тази спънка екипът е подбрал ензим, който катализира сходна реакция – добавяне на кислород към субстрата. Във вида, срещан в природата, той не може да взаимодейства с феруловата киселина, което налага да бъде модифициран. С помощта на симулации са установени подходящите места за редакция – оказва се, че е нужна промяна само на три аминокиселини.

Така модифицираният ензим е изключително ефективен и може да катализира реакцията без кофактори (допълнителни молекули, които са нужни на някои ензими) при стайна температура. За протичането ѝ е нужно само смесването му с феруловата киселина и аериране на сместа, за да се набави кислород за окислението ѝ, което прави процеса изключително икономичен и лесен за въвеждане. Производителността му също е много добра – грам ванилин за литър реакционна смес – и е по-висока от тази на немодифицирания ензим. Бонус е, че ензимът може да превръща във ванилин и други отпадни продукти – кумарова и синапинова киселина.

Това е сериозно постижение не само по отношение на производителността и гъвкавостта. Оптимизацията на ензими ни дава възможност да се възползваме от еволюционния процес и да го ускорим изкуствено, подобрявайки вече създаденото от природата. Така в производствата могат да се въведат реакции, които до момента не са били възможни или са били непрактични, и да се избегне отглеждането на растения, което обикновено изисква значителни ресурси.

Научни новини: Молекулярни терапии, CRISPR и една златна къртица

Post Syndicated from Михаил Ангелов original https://www.toest.bg/nauchni-novini-molekulyarni-terapii-crispr-i-edna-zlatna-kurtitsa/

Молекулярна терапия за молекулярно заболяване

Научни новини: Молекулярни терапии, CRISPR и една златна къртица

Терминът „молекулярно заболяване“ е въведен през 1949 г. в статията „Сърповидноклетъчна анемия, молекулярно заболяване“. Сравнявайки хемоглобин от здрави и болни хора, учените установяват, че между двете форми има малка разлика в подвижността им в електрическо поле, което предполага промяна в аминокиселинния им състав. В същото издание на Science е публикуван и генеалогичен анализ, показващ наследствения характер на заболяването. Тези разработки се правят само няколко години след като ДНК е доказана като носител на наследствената информация и преди да бъде описана нейната структура.

Сърповидноклетъчната анемия (СКА) е генетично заболяване, при което червените кръвни телца се деформират и придобиват С-образна форма. Поради това те не могат да снабдяват добре организма с кислород и започват да се слепват едно за друго. Въпреки че са разработени поддържащи терапии, които намаляват риска от инфаркт, инсулт и други остри прояви на заболяването, и продължителността на живот на пациентите е удължена значително, те все пак не живеят добре поради хронични пристъпи на остра болка, невъзможност за усилена физическа активност, бъбречна недостатъчност и др. Впечатляващото е, че всичко това е следствие от точкова мутация (промяната на нуклеотид) в ген, кодиращ един от протеините, които изграждат хемоглобин А. Това е като да се подмени една буква в първите три параграфа на тази статия.

Заболяването се проявява, когато дефектният ген е с две копия (хомозиготно състояние), получени от двамата родители. Интересен детайл е, че хората, носещи едно копие на дефектния ген (хетерозиготно състояние), имат повишена устойчивост към паразита, причиняващ малария. При заразяване червените кръвни телца се разпукват преждевременно, нарушавайки жизнения му цикъл. Счита се, че това е една от причините мутацията да се среща по-често в популации, където маларията е сериозен проблем, като Западна Африка и Индия.

Един от основните изводи в статията е нуждата от разработване на молекулярна медицина и 50 години по-късно това става реалност. Една от разновидностите ѝ са генните терапии, които бързо добиват популярност и вече има одобрени за редица заболявания. В общия случай при тях се използват вирусни вектори, които носят работеща версия на повреден ген, водещ до заболяване. Вирусите вмъкват работещата версия в генома на пациента и така възстановяват нормалното функциониране на организма. Механизмът е сходен с векторните ваксини, познати от пандемията от COVID-19. Може да се каже, че те, както и иРНК ваксините, също са вид молекулярна терапия.

В началото на месеца в САЩ одобриха Lyfgenia генна терапия за пациенти, страдащи от СКА, базирана на използването на вирус носител. Терапията се прилага върху хематопоетични стволови клетки – те се намират в костния мозък и са отговорни за създаването на нови червени кръвни телца. След извличането им от пациента се третират с лентивирус, носещ леко променена версия на хемоглобин А, която функционира коректно. Получените генномодифицирани клетки следва да са абсолютно идентични с пациентските, с изключение на промяната в споменатия ген. Това почти премахва опасността от отхвърлянето им при обратната трансплантация. За съжаление, преди новите модифицирани клетки да бъдат върнати в пациента, всички стари трябва да бъдат премахнати. Това се извършва с помощта на висока доза химиотерапия, която унищожава стволовите клетки в костния им мозък.

Одобрението се базира на клинично изследване, включващо 32 пациенти, които са проследени за период между 6 и 18 месеца, като през това време 88% от тях не са имали пристъпи на болка. Съобщава се и за негативни ефекти, но те са свързани с химиотерапията и самото заболяване. Притеснителното е, че трима от пациентите са починали – един поради усложнения от заболяването, но при другите двама причината е остра форма на левкемия. Компанията изтъква, че пациентите с това заболяване са по-предразположени към развитие на злокачествени процеси, и споменава, че левкемията може да се дължи и на цялата процедура по трансплантиране. Починалите пациенти са били подложени на по-стара версия на терапията, при която производството и трансплантацията са извършени по различен начин. Въпреки тези обяснения Американската агенция по храните и лекарствата поставя знак за особено внимание върху продукта.

Добрата новина е, че има и алтернативна генна терапия, базирана на CRISPR. Името на продукта е Casgevy и е разработен от Vertex Pharmaceuticals Inc. в партньорство с швейцарската Crispr Therapeutics. В средата на ноември той беше одобрен в Обединеното кралство, а в началото на декември получи зелена светлина и в САЩ (заедно с Lyfgenia). Това е първата одобрена генна терапия, базирана на системата за генетични редакции.

Подходът е подобен – от пациента се изолират стволови клетки, които вместо на вирусна трансформация се подлагат на генна редакция с CRISPR. Така в клетките не се вмъква вирусният генетичен материал, а само се променя функцията на един ген, като в случая учените са избрали малко по-различен метод. Вместо да коригират функцията на хемоглобин А, те активират производството на хемоглобин F (фетален хемоглобин). Той се произвежда в ембриона от около шестата седмица на бременността до няколко месеца след раждането, когато бива изместен от хемоглобин А, срещан при възрастните. Превключването между двата вида хемоглобин става след активирането на един ген – BCL11A. Чрез дезактивирането му с помощта на CRISPR синтезът на хемоглобин F се възобновява. Въпреки че не е типичен за възрастните, той успява да компенсира действието на увредения хемоглобин А и намалява симптомите от СКА.

Интересното е, че терапията е приложима и при друго заболяване, причинено от мутация в хемоглобин А – бета-таласемия. И при нея хемоглобинът не функционира правилно и също се наблюдава анемия, която в най-острата си форма води до смърт. За момента подходът за поддържане на пациентите се изразява в чести кръвопреливания, които носят своите усложнения.

В клиничното проучване са включени 45 пациенти със СКА, 29 от които проследени за над 18 месеца. 28 от тях не са имали пристъпи на болка поне една година, след като са получили модифицираните клетки. Резултатите са добри и при пациентите с бета-таласемия. 39 от 42 не са имали нужда от кръвопреливане поне една година след терапията, а при останалите трима нуждата от трансфузия е спаднала със 70%. Страничните ефекти се припокриват с тези, причинени от химиотерапията. Пациентите продължават да бъдат наблюдавани за забавени негативни ефекти, както и за да се установи колко дълготрайно е действието на терапията.

Компанията, разработила Lyfgenia (Bluebird Bio Inc.), също има продукт, който може да се прилага за бета-таласемия – Zyngeglo. Механизмът му на действие е почти идентичен, като разликата е в модифицирания ген. Той получава одобрение в Европа през 2019 г., а в САЩ – през 2022 г. В началото на 2021 г., след фаталните случаи в клиничното изпитване за СКА, приложението му е спряно временно, но след преглед на наличната информация Европейската комисия по лекарствата дава становище, че няма доказателства за връзка между развиването на левкемия и терапията, и продуктът отново е разрешен.

Въпреки че се прилагат еднократно, и двете терапии не са евтини поради сложната процедура по трансплантация и обработка на стволовите клетки. Цената за Lyfgenia е 3,1 млн. долара, а за Casgevy е с около 40% по-ниска – 2,2 млн. Куриозното е, че въпреки очаквания скок след полученото одобрение от Комисията по храните и лекарствата акциите и на двете компании са спаднали.

Преди разработването на тези терапии единствената възможност за облекчаване на заболяването е била трансплантацията на костен мозък от здрав донор. За съжаление, откриването на съвместими донори е рядко и процедурата за извличане на костен мозък включва сравнително тежка операция. Въпреки недостатъци си новите терапии имат огромен потенциал да са по-щадящи и надеждни. Най-вероятно ще бъдат подобрени, и то за много по-кратко време от 70-те години, изминали от установяването на причината за заболяването и възможността за модифициране на единични бази в ДНК на пациентите.

Сходно мнение изказва и една от откривателките на CRISPR – нобеловата лауреатка Дженифър Даудна. В интервю за WIRED тя споделя, че тези терапии ще стават все по-неинвазивни и въпреки че в момента може да ни се струва като фантастика, най-вероятно в бъдеще ще се приемат под формата на таблетка.

CRISPR е многолик и навсякъде

Както вече сме споменавали, всички организми оставят издайнически следи под формата на ДНК в околната среда (environmental DNA). При микроорганизмите това е малко по-различен процес, тъй като те просто се отлагат по повърхностите, от които се вземат проби. Въпреки това наличието им в събрания материал може да бъде много интересно. Не само за определяне на разпространението им и за следене на потенциални огнища на заболявания, но и за откриване на нови или слабо познати видове. Поради все по-голямата достъпност на услугите за секвениране броят на секвенирани проби расте. В комбинация с огромния брой микроорганизми около нас, които попадат в пробите, се стига до главоломно нарастване на микробиални ДНК секвенции в базите данни. Така обработването и търсенето на интересни фрагменти в тях става все по-сложна задача за биоинформатиците.

За справяне с този проблем екип от Масачузетския технологичен институт предлага нов подход, базиран на алгоритми, които се използват и в момента. Първо последователностите се отделят в обособени групи, които са съставени от секвенции с висока сходност. След това групите се сравняват една с друга, което помага за откриване на взаимовръзки и еволюционни промени. По този начин се използват предимствата и на двата алгоритъма, като се избягват недостатъците им – трудното откриване на прилика между участъци с по-малка сходност на първия и по-бавната работа на втория.

С помощта на този алгоритъм се откриват 188 нови системи, в които CRISPR взема участие. Във формата, използвана в съвременните биотехнологии, той най-често е свързан с Cas9 – ензим, който има способността да реже молекулата на ДНК. Но към него може да се прикачат редица други молекули. Лабораторно разработен вариант е комплексът от CRISPR и флуоресцентно багрило, позволяващ да се „освети“ строго специфичен участък от ДНК, което може да е полезно при определяне на точното му местоположение в клетките. Но природата разполага с много по-богато въображение.

Част от описаните варианти имат ензим, който може да реже РНК вместо ДНК. При други ензимът е от групата на транспозазите – те имат способността да „преместят“ участък ДНК от едно място на друго в генома. Тези комбинации не са непознати, но откриването на нови примери показва, че разнообразието най-вероятно е голямо. Интересна изненада е вирусен протеин, който може да се свърже с CRISPR и да го дезактивира, като така блокира защитната система на бактериите.

Както отбелязват авторите, тези открития могат да бъдат изключително ценни за биотехнологиите и да дадат път на нови терапии или да бъдат приложени в земеделието и да са от помощ за намаляване на ефекта от глобалните климатични промени. Откритията също показват колко ценно може да бъде събирането и секвенирането на ДНК от околната среда.

Напредъкът в технологиите за секвениране и биоинформатичната обработка на данните разкриват нови хоризонти пред нас и постоянно ни носят изненади за света, който ни заобикаля. А понякога дават шанс за разплитането на почти столетни мистерии.

Златна изненада под пясъка

Къртицата на Де Уинтън принадлежи към семейство Златни къртици и е ендемична за западните брегове на Южна Африка. За последен път такава къртица е била забелязана през 1937 г., което ѝ осигурява място в списъка на критично застрашени или предполагаемо изчезнали видове. Като цяло това не е чак толкова учудващо – бозайникът е с размер на мишка и козината му е пясъчнозлатиста, поради което се открива трудно.

За да проверят дали могат да го намерят, екип учени решава да използва ДНК, събрана от околната среда. Най-лесният начин да се открият къртиците е да се намерят техните къртичини. За съжаление, това не е така за хората, защото в повечето случаи леговищата трудно се забелязват на повърхността. На помощ се притичва куче търсач на име Джеси, което насочва изследователите. Щом намерят къртичините, учените вземат от тях почвени проби, от които е изолирана ДНК и после я сравняват с известните секвенции на представители на семейството. Това не е лесна задача, защото в него има видове, които се срещат по-често, и повечето сигнали са от тях. Но в данните учените откриват златна нишка – митохондриална ДНК, която съвпада с тази на къртицата на Де Уинтън. 

Учените не само доказват, че видът все още се среща, но и определят сравнително широк ареал на обитание, който обаче има малък брой представители. Откритието е повод за радост, но също така насочва вниманието към неотложната нужда от по-задълбочени проучвания на местността. Новооткритата популация е застрашена както от предполагаемо ограничения брой индивиди, така и от дейността на човека – в района активно се добиват диаманти, което е причина за разрушаване на множество екосистеми.

Водещо изображение: Chrysochloris holosericea – рисунка от колекцията на Университета в Амстердам. Източник: Wikimedia Commons